Satu kajian metagenomik baru-baru ini telah mendedahkan spektrum virus dan bakteria yang sangat pelbagai yang dibawa oleh tikus di Wilayah Heilongjiang, termasuk virus Lassa, virus Amur, Salmonella, dan Yersinia pestis.
Penyelidikan tersebut menggunakanKit Pengayaan RNA Patogen daripada Makro & Mikro-Ujian, berdasarkan teknologi penangkapan prob. Dengan mengurangkan rRNA perumah dan serpihan perumah lain yang terpelihara secara selektif, kaedah ini mengekalkan RNA mikrob dengan berkesan, meningkatkan kepekaan pengesanan patogen dengan ketara. Langkah pengayaan RNA patogen ini adalah penting dalam mencapai kadar pengesanan yang tinggi dan menyediakan sokongan teknikal yang kukuh untuk pengawasan patogen.
Tikus: Takungan Utama Penyakit Zoonotik
Tikus merupakan kumpulan mamalia yang paling kaya dengan spesies dan tersebar luas, merangkumi lebih daripada 2,000 spesies di seluruh dunia dan menyumbang lebih 40% daripada semua spesies mamalia.
Selain kepentingan ekologinya, tikus berfungsi sebagai takungan dan vektor utama pelbagai patogen zoonotik.Oleh kerana habitat tikus sering bertindih dengan persekitaran manusia—melalui gigitan langsung, sentuhan dengan najis, atau penularan tidak langsung melalui kutu dan hama—patogen yang dibawanya menimbulkan ancaman kesihatan awam yang berterusan.
Terutamanya, lebih daripada 70% penyakit berjangkit yang baru muncul berasal dari hidupan liar, dengan tikus mewakili salah satu takungan virus yang paling penting.
Wilayah Sempadan Heilongjiang: Barisan Hadapan untuk Pengawasan Patogen
Heilongjiang, sebuah wilayah sempadan di timur laut China, mempunyai sumber ekologi yang banyak dan berkongsi sempadan dengan pelbagai negara. Gabungan biodiversiti yang kaya dan pergerakan penduduk rentas sempadan yang kerap mewujudkan keadaan yang menggalakkan untuk penularan patogen.
Antara Jun dan Julai 2021, para penyelidik telah mengumpulkan 67 ekor tikus liar dari Pekan Hengdaohezi, Bandar Mudanjiang. Sampel-sampel tersebut termasuk:
1 20Semenanjung Apodemus
l 47Myodes rufocanus
Semua spesimen telah ditangkap di kawasan perumahan dan tanah pertanian di sekitarnya, menonjolkan hubungan rapat antara penempatan manusia dan habitat hidupan liar.
Teknologi Pengayaan Patogen: Mengatasi Gangguan Latar Belakang Perumah
Dalam penjujukan metagenomik, RNA perumah biasanya mendominasi bacaan penjujukan, menutupi isyarat patogen berkelimpahan rendah.
Bagi menangani cabaran ini, kajian ini telah menggunakanKit Pengesanan Metagenomik Patogen Makro & Mikro-Test. Menggunakan teknologi penangkapan prob, prob yang direka khusus mengikat rRNA perumah dan urutan terpelihara, membolehkan pengurangannya dan dengan itu memperkayakan RNA mikrob.
Pendekatan ini telah meningkatkan kepekaan pengesanan patogen dengan ketara, membolehkan penjujukan hiliran mendapatkan semula kadar bacaan patogen yang lebih tinggi. Langkah pengayaan ini telah meletakkan asas yang kukuh untuk mencirikan spektrum patogen yang dibawa oleh tikus dengan tepat.
Selepas pengayaan, sampel RNA menjalani transkripsi songsang, pembinaan perpustakaan dan penjujukan daya pemprosesan tinggi. Analisis bioinformatik termasuk:
Penapisan genom perumah l
Pengelasan taksonomi menggunakan Kraken2
Pembetulan kelimpahan dengan Bracken
Aliran kerja ini menghasilkan profil komprehensif komuniti virus dan bakteria.
Penemuan Penyelidikan: Peredaran Bersama Pelbagai Virus dan Bakteria
Penemuan Virus
Virus yang dikesan tergolong dalam 21 keluarga virus, termasukArenaviridaedanHantaviridae.
Melaluide novopemasangan menggunakan Megahit, 154 kontinjen virus telah dihasilkan, yang mana 110 daripadanya diselaraskan dengan 19 virus daripada lapan keluarga.
In Semenanjung Apodemus, virus berikut telah dikenal pasti:
l Arenavirus: virus Lassa, virus Wenzhou, virus Gairo
l Hantavirus: virus Amur, virus Puumala
In Myodes rufocanus, Arterivirus tikus dan virus Amur telah dikesan.
Antara patogen ini:
Virus Lassa merupakan agen penyebab demam berdarah virus, dengan kadar kematian kes mencecah kira-kira 20%.
Virus Amur merupakan salah satu patogen yang bertanggungjawab untuk demam berdarah dengan sindrom buah pinggang (HFRS). China melaporkan beban jangkitan hantavirus tertinggi di dunia.
Penemuan Bakteria
Sebanyak 1,051 genera bakteria telah dianotasi.
Genera yang paling banyak ialah:
lSalmonella(26–31%)
lYersinia(11–23%)
Salmonellamerupakan patogen bawaan makanan utama, yang bertanggungjawab terhadap anggaran 9 juta kes demam kepialu dan kira-kira 110,000 kematian setiap tahun di seluruh dunia.
Yersinia pestis, agen penyebab wabak, telah bertanggungjawab terhadap tiga pandemik bersejarah. Wilayah Heilongjiang diiktiraf sebagai salah satu fokus wabak semula jadi China dan kekal sebagai wilayah keutamaan untuk pengawasan wabak.
Kepentingan Kajian
Sumbangan Saintifik
Kajian ini merupakan laporan pertama serpihan virus Lassa dan virus arteritis tikus dalam tikus dari Heilongjiang, mengembangkan pangkalan data patogen bawaan tikus China.
Ia secara sistematik mencirikan komuniti virus dan bakteria dalam populasi tikus tempatan, menyediakan data asas untuk pengawasan penyakit zoonotik di kawasan sempadan.
Implikasi Kesihatan Awam
Penemuan ini menekankan keperluan untuk pengawasan berterusan dan penyaringan patogenA. semenanjungdanM. rufocanus.
Data ini menyediakan bukti saintifik yang menyokong strategi kawalan sumber untuk penyakit seperti wabak dan demam berdarah dengan sindrom buah pinggang.
Kekuatan Metodologi
Penjujukan metagenomik membolehkan pengesanan tidak berat sebelah bagi kedua-dua patogen yang diketahui dan baharu.
Dalam kajian ini, teknologi pengayaan patogen Macro & Micro-Test menunjukkan prestasi yang kukuh, dengan berkesan meningkatkan pengesanan patogen sasaran dalam sampel biologi yang kompleks. Keputusan tersebut mengesahkan keupayaannya untuk menyokong pengenalpastian patogen sensitiviti tinggi dalam pengawasan hidupan liar.
Cadangan Produk
Berdasarkan kejayaan aplikasinya dalam kajian ini, Kit Pengayaan RNA Patogen Makro & Mikro-Ujian sangat disyorkan untuk penyelidikan pengawasan metagenomik.
Dengan mengurangkan asid nukleik perumah dengan cekap dan memperkayakan jujukan mikrob, kit ini meningkatkan kepekaan pengesanan dan kualiti data dengan ketara. Ia mewakili alat penting untuk penemuan patogen yang tepat dalam sampel kompleks dan menyediakan sokongan teknikal yang mantap untuk pengawasan kesihatan awam, penilaian risiko zoonotik dan persediaan wabak.
Contact to learn more: marketing@mmtest.com
Masa siaran: 02-Mac-2026